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中山大学中山眼科中心单细胞转录组个性化数据线上分析系统项目采购单一来源公示


一、采购单位:中山大学中山眼科中心

二、采购项目名称:中山大学中山眼科中心单细胞转录组个性化数据线上分析系统项目

三、采购项目预算金额(元):人民币13万元

四、拟采购的货物或者服务的说明:

编号

功能模块

描述

1

细胞属性表

存储、显示细胞矩阵。

2

基因属性表

存储、显示基因表达信息。

3

样本属性表

存储、显示样本分组信息。

4

任务模块

显示任务、查看任务结果等。

5

图库模块

任务中产生的图永久存储。

6

报告模块

交付标准流程报告。

7

基因集

Marker基因。

8

细胞集

筛选过的细胞存储显示。

9

细胞定型

查看marker基因集聚类表达热图。

10

定型分组

存储、显示自定义分组信息。

11

样本分组

存储、合并、显示自定义分组信息。

12

个人中心

修改密码、样本信息、帮组文档等信息。

13

多级账户

多个账户可合并在一个账户里面管理。

14

表格工具

 

15

选择

选择数据信息,正选、反选。

16

显示列配置

显示想要看到的列,隐藏不想看到列。

17

固定列

固定显示某一列或某多列。

18

复制列

复制某一列信息,可更改列内容。

19

筛选列

筛选某一列中内容,如大于100的数值、模糊某一列的字符。

20

保存集合

保存所选结果到细胞集、基因集。

 

细胞工具:

 

21

小提琴QC

使用小提琴图展示各类细胞的QC分布。

22

Tsne/umap

tsne/umap/pca降维散点图上显示样本、聚类、QC等信息。

23

差异基因分析

指定不同类或者不同样本进行差异基因分析,对照组为空时,默认和处理组之外的所有细胞进行差异比较分析。

24

细胞异质性差异分析

计算亚群中所有细胞两两间的欧式距离并以箱线图的形式表示其分布,距离分布越高则表示该亚群细胞异质性越高。

25

细胞比例差异分析

比较样本或者分组之间各类细胞比例差异,寻找特有细胞亚群。

26

细胞轨迹分析

对选中的细胞进行伪时间排序,构建细胞拟时间序列轨迹,同时寻找与拟时间变化显著相关的基因。

27

基因表达筛选

根据基因表达值筛选细胞。

28

聚类

重新聚类

 

基因工具:

 

29

GO富集分析

使用clusterProfiler对选中基因集进行GO富集分析。

30

KEGG富集分析

使用clusterProfiler对选中基因集进行Patahway富集分析。

31

Marker基因表达热图

使用热图展示所选基因在各个亚群或者样本中的表达情况。

32

Marker基因表达小提琴图

使用小提琴图展示所选基因在各个亚群或者样本中的表达分布。

33

Marker基因表达散点图

使用降维后的细胞散点图展示所选基因在每个细胞中的表达情况。

34

基因平均表达热图

使用热图快速展示所选基因在各个亚群或者样本中的平均表达情况。

五、采用单一来源采购方式的原因及相关说明:

1、原因:

根据《中华人民共和国政府采购法》第三十一条的规定,采用单一来源方式采购,须符合下列情形之一:

1)只能从唯一供应商处采购的;

2)发生了不可预见的紧急情况不能从其他供应商处采购的;

3)必须保证原有采购项目一致性或者服务配套的要求,需要继续从原供应商处添购,且添购资金总额不超过原合同采购金额百分之十的;

4)法律法规规定的其他情形。

参照《中华人民共和国政府采购法》要求,本项目属上述规定的第 1 种情形。

2、说明:

因单细胞转录组数据存在解析困难等问题,无法准确系统全面的解析数据包含的细胞类别,需配备单细胞转录组个性化数据线上分析系统,该系统可识别在单细胞水平上研究各种组织包含的具体细胞类别,分析其差异。经了解,市场上符合项目建设要求只有北京新抗元生物技术有限公司销售的单细胞转录组数据个性化分析挖掘云平台,该系统可显著减少和节约分析者的工作量及时间,帮助科研人员分析单细胞数据故本次单细胞转录组线上分析软件系统只能从唯一供应商处采购。因此,本项目符合《中华人民共和国政府采购法》第三十一条第一款规定情形,拟采用单一来源采购方式采购,现进行单一来源采购公示。

六、拟定的唯一供应商名称、地址:

供应商名称:北京新抗元生物技术有限公司

供应商地址:北京市昌平区生命科学园路291B316-12

七、本公示期限(不得少于5个工作日)自20210112日至20210119日止。

八、联系事项

采购人:中山大学中山眼科中心

联系人:肖小姐

电话:020-87330352

联系地址:广州市天河区金穗路7

中山大学中山眼科中心

20210112

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