眼科研究所于1982年成立，主要对常见致盲眼病的病因、发病机理及其防治开展前沿性、基础性研究。在此基础上1991年又成立了卫生部眼科学实验室；2002年1月，获得教育部眼科学重点实验室立项；2003年1月，成为科技部和广东省共建国家重点实验室培育基地；2006年7月，科技部正式发文批准建设眼科学国家重点实验室。研究所现有视觉生理、眼生化、眼病理、眼免疫、眼遗传与分子生物学、玻璃体视网膜病和眼药理等实验室。此外，还开设黄斑病、小儿与遗传眼病等特色专科。

　　研究所现任所长为张清炯教授。吴乐正教授、陈家祺教授、葛坚教授和杨培增教授曾先后担任研究所所长。研究所现有科研人员和管理人员37人，其中正高职称7人, 副高职称12人， 11位具有博士学位，4位具有硕士学位，5位为博士生导师，7位为硕士生导师。

　　眼科研究所近十余年来，获得国家自然科学基金创新群体项目1项、国家杰出基金3项，1人被聘为“长江学者特聘教授”。 获得国家级课题 68项，国家级成果2项，已发表SCI论文155篇,著书17本。